自1982年中巴签署科技合作协定以来，两国科技交流与合作日益扩大和深入，技术人员和政府部门间互访频繁。双方在林业、水电、航空航天、电子信息、医药卫生、新材料、生物工程、和平利用核能、农牧业领域均签署了合作协议。迄今，双方已举行了6次政府间科技合作混委会。中巴地球资源卫星项目的合作被誉为高科技领域南－南合作的典范，受到两国领导人的高度重视。两国联合研制的地球资源卫星01星已于1999年10月成功发射，02星也将于2003年9月发射升空。2002年11月27日，中巴两国政府在巴西利亚正式签署了关于继续合作研制地球资源卫星03、04星的议定书。两国科技部还在信息技术、生物技术和新材料等多个领域开展了密切交流与合作。